《孙中山与南京》第一集“定都南京”（11月9日）
1912年1月1日深夜11时，孙中山在南京清两江总督署内宣誓就任中华民国临时大总统，以一场简朴的仪式宣告亚洲第一个共和国的诞生。
辛亥革命首先成功的是武昌，为何要在南京建都？仪式又为何在深夜举行呢？
武昌起义胜利后，各省纷纷宣布独立，清廷作垂死挣扎，重新启用袁世凯镇压革命。这时后院起火，第六镇统制吴禄贞截留军火，通电停止战争。袁世凯派人刺杀吴禄贞后，督师湖北，攻下汉口，致书革命军想逼其就范，没想到反被革命军劝说。
为凝聚南方各省的革命势力，湖北都督黎元洪邀请独立各省代表赴武昌筹建临时中央政府，而江苏都督程德全、浙江都督汤寿潜联名致电上海都督陈其美，提议各省派代表到上海商议，双方争执不下。因武昌是“起义首功”之地，联合会最后决定从上海溯江而上，到武昌开会。
当代表们到达湖北时，汉阳又失守，正在代表们一筹莫展之际，传来革命军攻克南京的好消息，代表们随即决定在南京建都。
远在美国的孙中山得知起义胜利的消息后，并没有立即回国，而是先去英法等国游说各国政要，打探他们的政治态度，并争取获得他们的支持。在得知列强采取“中立”态度后，才日夜兼程返回国内。11月29日，孙中山被选为临时大总统，终于在1912年元旦深夜宣誓就职。
《孙中山与南京》第二集“南北议和” （11月10日）
孙中山提议修改《中华民国临时政府组织大纲》，增设黎元洪为副总统，将行政五部增加为九部，在总长的人选中，代表们意见不一，黄兴从中斡旋，最后形成“总长取名、次长取实”的“次长内阁”制。各部纷纷寻找办公地点，在艰苦的条件下，纷纷出台各项法律规章，进行社会改革。
民国初年，南京城内情况复杂。孙中山特意成立“查街队”，执行纠查任务。总统府庶务科长缪思敬飞扬跋扈，百姓拦街告状，孙中山责令江苏都督庄蘊宽侦办，缪思敬被押赴刑场，执行枪决，南京的秩序开始恢复和好转。
南北和谈在艰难地进行着，当袁世凯听说唐绍仪与伍廷芳签署了五条草约后，拒不承认，唐绍仪被迫辞职。伍廷芳与袁世凯据理力争。南方革命派请大总统北伐的电报雪片般飞来。孙中山多方努力解决财政困难，甚至与日本签定中日合办汉冶萍公司的草约，但在国内外舆论压力下，被迫取消所定草约。即使如此，孙中山都没有放弃北伐的努力，他甚至想带兵北伐，被胡汉民劝阻。
正在南北僵持不下时，袁世凯在退朝回府的路上，遭同盟会京津分会的炸弹袭击，虽然没被炸死，但随即向革命党人表示效忠革命，紧接着宗社党领袖良弼又遭暗杀，清帝在万般无奈之下，被迫于1912年2月12日宣布退位，南北统一告成。
《孙中山与南京》第三集“临时约法” （11月11日）
清帝退位后，孙中山向参议院提出辞呈，并附临时政府所在地设于南京、新总统到南京就任后方解职、新总统必须遵守《临时约法》三项条件。2月15日，孙中山在总统府主持南北统一大典，随后参议院选举袁世凯为第二任临时大总统，为防止军人在选举中有过激行为，孙中山将部队带到明孝陵拜谒。袁世凯想尽一切办法，不来南京就职。
为限制新任大总统袁世凯的权力，南京临时政府制定了《中华民国临时约法》，由于历史的局限性，没有将孙中山赞成的女子平等参政的权利写入法律条款，引起想平等参政的女子们极大不满，女子参政总盟会在总理唐群英带领下，直闯参议院，与守卫发生冲突，孙中山不顾个人安危，带着女儿去调解。
根据临时约法，内阁总理的权力很大，孙中山与袁世凯为内阁总理的人选展开较量，最后采取折中的办法，由唐绍仪加入同盟会，担任民国首任内阁总理，孙中山在组阁中，尽最大努力争取同盟会的地位。
4月1日，孙中山正式解职。此后他发动了二次革命、护法战争等，继续为探索中国革命的道路而努力，1924年在中国共产党的帮助下，改组中国国民党，同年秋应冯玉祥邀请抱病北上，于1925年3月12日病逝北京。按照其遗愿，葬于南京中山陵，国民政府举行了隆重的奉安大典。
